En tus PDF existen imágenes?. Estoy probando ghotscript y para poder comprimir correctamente las imágenes bajan mucho de calidad.
Tienes que instalar Ghostscript primeramente en los clientes, configurar el PATH.
Utilizando esta configuración y probando con cmd:
gswin64 -sDEVICE=pdfwrite -dCompatibilityLevel=1.4 -dPDFSETTINGS=/ebook -dNOPAUSE -dQUIET -dBATCH -dColorImageDownsampleType=/Bicubic -dColorImageResolution=42 -dGrayImageDownsampleType=/Bicubic -dGrayImageResolution=42 -dMonoImageDownsampleType=/Bicubic -dMonoImageResolution=42 -sOutputFile=salida.pdf entrada.pdf
… un archivo de 534KB pasa a 386KB pero las imágenes se ven de esta forma…
… pero el texto queda correcto, no se visualiza pixelado.
Si aumenta mucho el tamaño en tu servidor, puedes ver para tenerlos en un FPT, y según necesidad vas descargando a tu equipo local.
También podrías ver convertir los PDF en un objeto Binario, aunque esto también estaría aumentando el tamaño de la BBDD. Mira esto: subir archivos via SDV o guardarlos en un campo tipo objeto binario? - nº 8 por vectorman